据不完全统计，国内至少有3000家生鲜电商，中国零售业生鲜研究中心委员李长明表示，99％的生鲜电商都在亏损。生鲜电商有着种种困难需要克服。

　　一是配送成本高昂。生鲜产品从供应商到最终消费者主要经历了干线运输、仓储和宅配三个环节。综合来看，在冷链外包的情况下，冷藏商品的干线运输与仓储成本是常温商品的4至5倍，而宅配成本是1.3至1.5倍。生鲜电商自行投资冷链要面临高昂的成本：一方面，冷链商品对比常温商品在仓储和物流方面要高；另一方面，生鲜产品的特殊性使其对配送时间要求严格，且生鲜产品配送的特殊要求使其难以与传统商品共享资源，导致订单密度不足。

　　二是生鲜产品的非标准化问题。非标品主要会造成两方面影响：一方面，不便于统一包装和配送；另一方面，影响消费者对产品的认可度，例如在网上下单时看到的是颜色鲜艳、大小一致的产品，但客户拿到却发现大小参差不齐，颜色也不鲜亮。这两点也是跟传统电商差异较大的地方，像3C、图书等实体产品跟图片差异不大，消费者容易接受，而且形状大小一致，方便包装和配送。

　　配送成本问题是目前生鲜电商面临的最大问题。不过，随着生鲜电商规模的扩大，配送成本有望逐步下降。同时，通过集中配送、自提柜和社区商店等方式可以在一定程度上解决生鲜电商‘最后一公里’的问题，配送成本有望得到进一步降低。其中，京东、天猫和顺丰优选分别凭借在供应链上的扁平化、营销手段的创新和领先的冷链宅配技术，树立了供应链、平台运营和仓储物流的行业新标准，大大提高了生鲜电商的准入门槛。